在基因的启动子区域(promotor region)通常存在一些富含重复双核苷酸“”的区域,称为“岛”( island)。在人类基因组内,存在有近 3 万个岛。这些岛不仅是基因的一种标志,而且还参与基因表达的调控和影响染色质的结构,更是 DNA 甲基化的位置。岛甲基化形态的扫描分析是基因表达和表观基因组学的主要课题。
产品内容
HEPENGBIO 扩增液(Reagent A) 微升
HEPENGBIO 补充液(Reagent B) 毫升
产品说明书 1 份
保存方式
保存在-20℃冰箱里;有效保证 6 月
用户自备
转化样品:经过亚硫酸盐转化的目标 DNA 分子特异引物:用于甲基化基因扩增的引导 DNA 分子PCR 仪:用于样品扩增
PCR 管或平板:用于 PCR 反应的容器
实验步骤
实验开始前,从-20℃冰箱中取出试剂,放进冰槽里融化。然后进行下列操作:
1. 针对一个样本,每次移出 xx 微升 HEPENGBIO 扩增液(Reagent A)到PCR 管
2. 加入 1 微升用户自备的的转化或野生型 DNA 样品(总量 100 纳克)
3. 分别加入 1 微升用户自备的甲基化特异性的引物 F 和引物 R(各 350 纳克或 25 微摩尔)
4. 再加入 xx 微升 HEPENGBIO 补充液(Reagent B)(反应总量为 25 微升)
5. 即刻放进微型台式离心机瞬时离心 5 秒,速度为 500g(或 2000RPM;例如 eppendorf 5415)
6. 加入 50 微升 PCR 级矿物油(注意:参见注意事项10)
7. 即刻进行热启动 PCR 反应:
 
	
		
 
8. 反应完毕后,移取 5 微升进行 1.8%琼脂糖凝胶电泳或 15%聚丙烯酰胺凝胶
9. 如果进行测序鉴定,胶回收 PCR 产物(建议使用 HEPENGBIO 高质纯化一步法胶回收试剂盒;
HEPENGBIO20051.1)
10. 分别移出 2 微升反应液到 2 个不同的新的 1.5 毫升离心管(每微升 100 纳克)
11. 加入 1 微升用户自备的甲基化特异性的巢式引物 F(每微升 350 纳克)到其中一个 1.5 毫升离心管,作好标记
12. 加入 1 微升用户自备的甲基化特异性的巢式引物 R(每微升 350 纳克)到另一个 1.5 毫升离心管,作好标记
13. 进行后续的直接测序反应
5. 即刻放进微型台式离心机瞬时离心 5 秒,速度为 500g(或 2000RPM;例如 eppendorf 5415)
6. 加入 50 微升 PCR 级矿物油(注意:参见注意事项10)
7. 即刻进行热启动 PCR 反应:
| 温度(℃) | 时间 | 循环 | 
| 95 | 9 分钟 | 1 | 
| 95 | 30 秒 | |
| Tm | 30 秒 | 35 | 
| 72 | 30 秒 | |
| 72 | 5 分钟 | 1 | 
8. 反应完毕后,移取 5 微升进行 1.8%琼脂糖凝胶电泳或 15%聚丙烯酰胺凝胶
9. 如果进行测序鉴定,胶回收 PCR 产物(建议使用 HEPENGBIO 高质纯化一步法胶回收试剂盒;
HEPENGBIO20051.1)
10. 分别移出 2 微升反应液到 2 个不同的新的 1.5 毫升离心管(每微升 100 纳克)
11. 加入 1 微升用户自备的甲基化特异性的巢式引物 F(每微升 350 纳克)到其中一个 1.5 毫升离心管,作好标记
12. 加入 1 微升用户自备的甲基化特异性的巢式引物 R(每微升 350 纳克)到另一个 1.5 毫升离心管,作好标记
13. 进行后续的直接测序反应


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